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微生物进化树构建方法 进化树的{读:de}构建方法?

2025-03-13 03:05:36Open-SourceComputers

进化树的构建方法?工具/原料电脑MEGA软件方法/步骤1、在NCBI上搜索所需的目的序列。2、以Metallothionein(MT)为例,将所需目的序列复制到Word上,形成如图格式。3、下一步用MEGA7构建进化树

进化树的构建方法?

工具/原料

  • 电脑
  • MEGA软件

方法/步骤

1、在NCBI上搜索所需的目的序列。

2、以Metallothionei直播吧n(MT)为例,将所需目(拼音:mù)的序列复制到Word上,形成如图格式。

3、下一步用MEG澳门新葡京A7构建进化树。首先打(练:dǎ)开MEGA,然后点击Align,点击Edit/Build Alignment,然后在弹出的小框中选择Create a new alignment,点击OK,根据你的需求选择Protein或DNA,如果比对的是核酸则点击DNA,若是蛋白质则点Protein.在此以Protein为例。

4、点击Protein,出澳门新葡京现如下第一张图所示,然(拼音:rán)后将目的序列粘贴。

5、点击Date菜单中{读:zhōng}的Ph澳门新葡京ylogentic Analysis点击Yes,然后在主菜单中点击Analysis,点击Phylogeny并选择第二个。点击YES,然后在弹出的框中点击compute。

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6、下图即为所构建的进化树。

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细菌16S rDNA序列分析以后,怎么构建进化树?

有很多方法,可以下载软件也可以在线构建。在线构建可将你的序列输入PUBMED的Blastn中进行对比,结果中有一种就是系统发育树,但里面残余对比的序列太多,逆序挑选一下。软件有很多,比较简单的是DNAstar中的Megalin,但结果比较粗。推荐用ClustalX软件进行同源性比对后,运用MEGA3.0软件进行系统发育分析并绘制系统发育树,也很简单,看看说明就会。比较公认的严谨的是philip系列软件,但操作复杂

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