生物分子动力学是什么？分子动力学是一门结合物理，数学和化学的综合技术。分子动力学是一套分子模拟方法，该方法主要是依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动，以在由分子体系的不同状态构成的系统中抽取样本，从而计算体系的构型积分，并以构型积分的结果为基础进一步计算体系的热力学量和其他宏观性质
生物分子动力学是什么？
分子动力学是一门结合物理，数学和化学的综合技术。分子动力学是一套分子模拟方法，该方法主要是依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动，以在由分子体系的不同状态构成的系统中抽取样本，从而计算体系的构型积分，并以构型积分的结果为基础进一步计算体系的热力学量和其他宏观性质。分子对接和分子动力学模拟区别？
分子对接与全局最优化方法 分子对接 配体－受体的相互作用 结合自由能的理论计算 优化方法 配体与受体的相互作用 生理过程与其有关 生物大分子与大分子之间 小分子与生物大分子之间 蛋白质的生理和药物作用体现澳门永利在蛋白质与小分子之间 结合自由能的理《lǐ》论计算 静电相互作用 氢键相互作用 范德华相互作用 疏水作用 结合自由能的理论计算 几何形状互补 静电相互作用互补 氢键作用互补 疏水作用互补 。
分子动力学模拟什么软件比较好？
一般有机物优选gromacs，核酸模拟优选amber，大体系（比如粒子数十万到上亿）优选lammps，MS不是分子动力学模拟的软件，不过其中的forcite和gulp模块可以做分子动力学。具体选择哪个软件，关键看你能找到哪个软件能用的势表或力场。gulp可以直接输入势参数计算，但是对势表支持不好，能支持的势的函数形式也有限，但它做几何优化是非常厉害的，其实它更多的是一个分子力学软件。gromacs我只用来算过蛋白质分子，它可以用gromos，oplsaa，charmm力场，不过经常遇到找不到某些分子的力场参数的问题，需要自己找工具来修补。amber没有用过，只知道它的力场算核酸很厉害，对于pistack相互作用有一定的描述。lammps我用来算金属，用得最多，相变和力学问题都算过，计算模拟非常强大，不过建模和后期处理功能偏弱，需要自己有较强动手能力，或找其它工具软件配套，建议使用前先有bash和python的基础，还有就是自带的势表非常少，需要自己去文献中找参数来做势表，或者到美国那几个网站去下载，lammps可以混合使用几种不同的势的形式，它称之为pair_hybrid
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