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生物信息学一些基本的常用软件有哪些?
序列拼接软件:velvet,SOAPdenvoo,SSAKE,ABySS,Trinity 等短序列比对软件: bwa,bowtie,tophat,SOAPAligner 等局部比对软件:Blast,blat,CorssMatch 等多序列全局比对软件:Muscle,clustalw 等基因预测软件:Glimmer,GeneMark,Augustus,FgeneSH,SNAP,GeneScan,EuGENE,Glean等重复序列预测软件:RepeatMasker,TRF等聚类软件:MCL,hcluster_sg等统计软件:pLINK,TASSEL,R,SPSS等...生物信息学一些基本的常用软件有哪些?
最常用的东西:1,你需要会用Linux,会使用bash2,高于入门级的统计学知识,以及一门统计语言,比如R3,至少一门编程语言,一般来讲C ,Perl,Python,Java这几种中的一种。4,对于你工作的领(繁:領)域,需要懂这方面的生物学知识,也需要皇冠体育知道目前人们在这个领域里都用什么其他软件。
以上娱乐城四点我觉得(读:dé)必不可少。
其他澳门银河的知识则{pinyin:zé}取决于你是什么领域。
比如如果你皇冠体育要研发高性能的序xù 列比对软件,则算法和并行计算的知识必不可少。
——本人自己算法很渣,所以没有把算啊列在以上必备的知识里。
如果要频繁存取大量数据,则懂得一种数据jù 澳门新葡京库必不可少,比如MySQL。
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